آثار علمی
کتابهای محمد هادی معرفت در شناخت قرآن و مفسران و همچنین تفسیر قرآن، مورد مراجعهٔ بسیاری از دانش پژوهان در حوزههای علمیه و دانشگاههای اسلامی قرار گرفته است. از جمله مهمترین آثار او کتاب «التمهید» است که در شش مجلد به علوم قرآنی و شناخت ویژگیهای خاص قرآن کریم اختصاص دارد. کتاب دیگر وی در دو مجلد، کتاب «التفسیر و المفسرون فی ثوبه القشیب» است که در آن به معرفی مفسران اسلامی و ویژگیهای تفاسیر آنان در طول تاریخ پرداخته است. معرفت کتابی نیز در تاریخ قرآن و چگونگی جمعآوری و کتابت آن تألیف کرده است. او آثار مهم دیگری در حوزه مطالعات قرآنی چون «صیانه القرآن من التحریف»، «شبهات و ردود حول القرآن الکریم» و «التفسیر الاثری الجامع» نگاشته است
وفات
سرانجام وی تنها یک روز پس از برگزاری مراسم نکوداشتش در قم وفات کرد. پیکر او پس از اقامه نماز توسط آیتالله شبیری زنجانی در حرم حضرت معصومه به خاک سپرده شد.رهبر انقلاب اسلامی آیتالله خامنهای به مناسب فوت ایشان، پیام تسلیت صادر کرد
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.